。
在過去，作物育種篩選是基于在田間觀察到的自然表型性狀。但這種方法有很多缺點(diǎn)：
1.環(huán)境因素影響表型性狀的選擇，導(dǎo)致選育不良。
2. 可能導(dǎo)致狹窄的種質(zhì)資源基因庫，阻礙了種質(zhì)資源的利用效率。隨著育種技術(shù)的發(fā)展，尤其是分子標(biāo)記輔助選擇(MAS)，對提高育種效率有很大幫助。分子標(biāo)記不受任何環(huán)境因素的干擾，且在選擇過程中是準(zhǔn)確的。
下一代測序(NGS)技術(shù)提供了開展基因組輔助作物改良的平臺(tái)。NGS技術(shù)通過genome-wide association studies (GAWS)或whole-genome association studies(WGAS)用于基因組選擇或全基因組選擇(GS)。Genomic-assisted工具有助于從龐大的種質(zhì)資源中快速選擇理想的性狀，減少育種時(shí)間，確認(rèn)并驗(yàn)證基因庫中感興趣的基因。
NGS提供高通量genotyping by sequecing（GBS）技術(shù)，這將幫助高通量分子標(biāo)記的檢測以及加快分子標(biāo)記輔助選擇。一些研究人員已經(jīng)成功地采用了GBS技術(shù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。一種先進(jìn)的基因分型系統(tǒng)有助于找到SNP，以便在很多作物中發(fā)現(xiàn)有價(jià)值的QTL/基因。例如，通過GBS技術(shù)，Spindel等[1]發(fā)現(xiàn)控制籽粒產(chǎn)量和花期的QTL水稻的優(yōu)良育種品系。這項(xiàng)研究確定了73,147個(gè)新型SNP標(biāo)記。Huang等[2]采用GBS技術(shù)評估了517個(gè)地方品種水稻的特征性狀，并鑒定有價(jià)值的QTL，包括分蘗數(shù)、谷粒寬度和長度，小穗數(shù)，糊化溫度，直鏈淀粉含量，針尖顏色，果皮顏色，果皮顏色、抽穗期、耐旱性和種子粉碎程度。GWAS對農(nóng)業(yè)形態(tài)學(xué)和其他有價(jià)值性狀的作用在許多作物中都有報(bào)道，例如水稻、玉米、小麥、大麥、高粱、珍珠粟、小粟等。所以，GWAS提供了精準(zhǔn)育種的可能性。表型組學(xué)和基因組學(xué)平臺(tái)的發(fā)展促使GS進(jìn)行有效的作物改良，也有助于發(fā)展先進(jìn)的作物改良育種技術(shù)。
參考文獻(xiàn)
1. Spindel, J.; Begum, H.; Akdemir, D.; Virk, P.; Collard, B and etc. Genomic selection and association mapping in rice (Oryza sativa): effect of trait genetic architecture, training population composition, marker number and statistical model on accuracy of rice genomic selection in
elite, tropical rice breeding lines. PLoS Genet., 2015, 11(2), e1004982.
2.Huang, X.; Wei, X.; Sang, T.; Zhao, Q.; Feng, Q.; Zhao, Y and etc. Genome-wide association studies of 14 agronomic traits in rice landraces. Nat. Genet., 2010, 42(11), 961-967.
3.. Thumadath Palayullaparambil Ajeesh Krishna1, Duraipandiyan Veeramuthu, Theivanayagam
Maharajan1 and Mariapackiam Soosaimanickam. The era of plant breeding: conventional breeding to genomics-assisted breeding for crop improvement Current Genomics, 2023, 24, 24-35
（文章來源：mp.weixin.qq.com/s/hGsvq20-Q49LhKoiZD4ouw）
