實(shí)體瘤MRD檢測(cè)主要有兩種策略：一種是基于腫瘤組織變異的腫瘤知情分析（tumor-informed），一種是不依賴腫瘤組織信息的腫瘤不知情分析（tumor-agnostic）。
Tumor-informed：通過(guò)基于腫瘤組織進(jìn)行NGS測(cè)序，針對(duì)個(gè)體腫瘤特有的變異進(jìn)行定制化的設(shè)計(jì)和分析，從而合成定制化Panel，然后對(duì)患者的血液樣本進(jìn)行個(gè)性化 追蹤，從而檢測(cè)和定量ctDNA。
Tumor-agnostic：不需腫瘤組織信息，直接對(duì)患者的血液樣本進(jìn)行NGS檢測(cè)，利用預(yù)先設(shè)定的癌基因突變Panel或者機(jī)器學(xué)習(xí)算法篩選預(yù)設(shè)腫瘤高頻變異位點(diǎn)，針對(duì)主要癌種或特定癌種進(jìn)行分析。
在非轉(zhuǎn)移性肺癌患者中，一些患者可以通過(guò)手術(shù)切除、放療和包括化療在內(nèi)的綜合治療。事實(shí)上，通過(guò)影像學(xué)檢查發(fā)現(xiàn)的復(fù)發(fā)或病變進(jìn)展時(shí)，患者全身腫瘤負(fù)荷明顯增加。因此，對(duì)于根治性切除非小細(xì)胞肺癌的患者，在腫瘤負(fù)荷增加之前，MRD檢測(cè)是否可以識(shí)別復(fù)發(fā)的危險(xiǎn)以及提供個(gè)性化的輔助治療引起廣泛的關(guān)注。
TRACERx研究顯示MRD可以預(yù)測(cè)常規(guī)影像學(xué)檢查前的復(fù)發(fā)，且超過(guò)99%以上MRD陰性患者治療后無(wú)復(fù)發(fā)。
Gale等人報(bào)告，采用腫瘤特異性變異的48個(gè)擴(kuò)增子，使用腫瘤特異性分析方法對(duì)每位患者進(jìn)行術(shù)后MRD監(jiān)測(cè)。48例患者術(shù)后1-3天采集樣本，12份樣本(25%)檢測(cè)到ctDNA, eVAF中位數(shù)為0.0026%。因此，在完全切除的情況下，ctDNA可能以低濃度短暫存在于血液中。伴有原發(fā)性腫瘤的臨床復(fù)發(fā)患者中，18/28(64.3%)檢測(cè)到ctDNA。ctDNA檢測(cè)的臨床特異性>98.5%，并先于患者中臨床復(fù)發(fā)的中位數(shù)為212.5天。
最近幾年，越來(lái)越多的研究數(shù)據(jù)支持MRD在各實(shí)體瘤的復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)的作用。為了快速推動(dòng)MRD的臨床應(yīng)用，奧美泰克提供MRD檢測(cè)的NGS文庫(kù)制備自動(dòng)化方案，采用iLab-200 全自動(dòng)基因測(cè)序文庫(kù)制備儀，可自動(dòng)化實(shí)現(xiàn)1-96個(gè)樣本ctDNA的建庫(kù)、探針雜交捕獲、雜交后洗脫、PCR擴(kuò)增、文庫(kù)pooling等流程。
參考文獻(xiàn)
1.Abbosh, C., Birkbak, N. J., Wilson, G. A., Jamal-Hanjani, M., Constantin, T., Salari, R.,et al. (2017). Phylogenetic ctDNA analysis depicts early-stage lung cancer evolution.Nature 545 (7655), 446–451. doi:10.1038/nature22364
2.Gale, D., Heider, K., Ruiz-Valdepenas, A., Hackinger, S., Perry, M., Marsico, G., et al.(2022). Residual ctDNA after treatment predicts early relapse in patients with earlystage non-small cell lung cancer. Ann. Oncol. 33 (5), 500–510. doi:10.1016/j.annonc.2022.02.007
3.Lemei Zhu,Ran Xu, Leilei Yang, Pingping Bing et al. Minimal residual disease (MRD)
detection in solid tumors using circulating tumor DNA: a systematic review. Front Genet. 2023; 14: 1172108. doi: 10.3389/fgene.2023.1172108
（文章來(lái)源：mp.weixin.qq.com/s/7tZRJ6QYLmPsGDM4AmL7iA）
