兩個位于同一個ATAC-seq peak上的變異位點rs7922621和rs7910643,它們與AD風(fēng)險相關(guān),但只有rs7922621可以通過改變開放染色質(zhì)狀態(tài)影響TSPAN14基因的表達。使用prime editing技術(shù)進一步驗證,將rs7922621和rs7910643的風(fēng)險等位基因轉(zhuǎn)換為非風(fēng)險等位基因,發(fā)現(xiàn)只有rs7922621編輯后的類小膠質(zhì)細胞中,TSPAN14的表達升高,并且細胞表面的ADAM10水平增加,sTREM2水平也增加。結(jié)果表明,rs7922621是導(dǎo)致TSPAN14下調(diào),細胞表面ADAM10水平和sTREM2水平下降,以及AD風(fēng)險增加的因果變異。
該研究提出了一個模型:rs7922621風(fēng)險等位基因(A/C)降低了TSPAN14增強子區(qū)域的染色質(zhì)開放性,導(dǎo)致TSPAN14的轉(zhuǎn)錄水平下降。TSPAN14基因的表達下降進而影響了它與ADAM10的相互作用,導(dǎo)致細胞表面的ADAM10水平下降。細胞表面的ADAM10水平下降進一步導(dǎo)致sTREM2水平的下降。sTREM2水平的下降使得小膠質(zhì)細胞失去了對AD發(fā)病機制的抵抗能力,從而增加了AD的風(fēng)險。
綜上,該研究通過應(yīng)用一系列技術(shù)手段,找到真正的功能性位點及其調(diào)控的基因,從而深入解析了風(fēng)險位點與疾病相關(guān)的功能特性,將對未來進一步探索更多的復(fù)雜疾病相關(guān)位點,精準(zhǔn)定位致病位點和揭示遺傳機制,并且提高早期診斷、新藥研發(fā)以及開發(fā)個體化療法的能力具有指導(dǎo)意義??焖贉?zhǔn)確檢測AD相關(guān)生物標(biāo)志物對于疾病的早期診斷、個體化治療、臨床試驗和預(yù)后評估具有重要意義。
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