安進(jìn)(Amgen)子公司deCODE Genetics的科學(xué)家進(jìn)行的一項(xiàng)新研究表明，序列變異推動(dòng)了DNA甲基化和基因表達(dá)之間的相關(guān)性。同樣的變異與各種疾病和其他人類特征有關(guān)。
這項(xiàng)研究發(fā)表在今天的科學(xué)雜志《自然遺傳學(xué)》上，標(biāo)題為:CpG甲基化和基因表達(dá)之間的相關(guān)性是由序列變異驅(qū)動(dòng)的。
納米孔測(cè)序是ONT (Oxford Nanopore technology)開發(fā)的一項(xiàng)新技術(shù)，使我們能夠?qū)崟r(shí)分析DNA序列。利用這項(xiàng)技術(shù)，DNA分子通過微小的蛋白質(zhì)孔被繪制出來，電流的實(shí)時(shí)測(cè)量表明DNA中的哪些核苷酸通過了孔。這樣就可以讀取DNA中的核苷酸序列，同時(shí)也可以通過這些相同的測(cè)量來檢測(cè)核苷酸的化學(xué)修飾。
其中一種修飾被稱為DNA甲基化，它被認(rèn)為是決定在任何給定時(shí)間使用哪些基因的重要因素;通常被該領(lǐng)域的科學(xué)家稱為基因表達(dá)調(diào)控。納米孔測(cè)序技術(shù)可以直接測(cè)量DNA甲基化，同時(shí)也比現(xiàn)有技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)的DNA序列讀取時(shí)間更長(zhǎng)。這些進(jìn)展通過測(cè)量人類基因組中所有CpG位點(diǎn)的DNA甲基化提供了新的機(jī)會(huì)，并且由于這項(xiàng)技術(shù)可以讀取長(zhǎng)DNA序列，因此可以分別確定來自父母雙方染色體上的DNA甲基化。
在這項(xiàng)研究中，科學(xué)家們能夠?qū)pG甲基化、基因表達(dá)和序列變異的等位基因分配給親本染色體，從而使他們能夠在單倍型水平上研究三組測(cè)量結(jié)果之間的相關(guān)性。該研究表明，序列變異會(huì)影響DNA甲基化，此外，其中一些變異可能與各種疾病以及其他人類特征有關(guān)。重要的是，該研究表明DNA甲基化與基因表達(dá)之間的相關(guān)性可歸因于序列變異，表明這些變異是驅(qū)動(dòng)因素。
大多數(shù)與疾病相關(guān)的序列變異都是在非編碼基因組中發(fā)現(xiàn)的，即基因組中不編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域。因此，很難理解非編碼序列變異是如何導(dǎo)致疾病的。通過研究對(duì)DNA甲基化的影響，科學(xué)家們能夠證明，許多這些變異對(duì)應(yīng)于以前與疾病相關(guān)的序列變異，從而使我們能夠更好地了解它們是如何導(dǎo)致疾病進(jìn)展的。
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2024-7/20240724174306405.htm） | 
