研究人員在后顱窩組A (PFA)室管膜瘤的基因組中發(fā)現(xiàn)了獨(dú)特的三維特征TULIPs，這是一種難以治療的腦腫瘤，在非常年幼的兒童中被診斷出來。這一發(fā)現(xiàn)由貝勒醫(yī)學(xué)院、德克薩斯兒童醫(yī)院、麥吉爾大學(xué)和合作機(jī)構(gòu)的一組研究人員發(fā)表在《細(xì)胞》雜志上，可能會(huì)導(dǎo)致新療法的發(fā)展。
“PFA室管膜瘤是致命的。放射治療是目前唯一可用的治療方法，不能治愈，而且會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的發(fā)育和認(rèn)知問題。PFA的有效治療進(jìn)展甚微的原因之一是，大多數(shù)這些腫瘤缺乏驅(qū)動(dòng)其生長的明確基因突變。由于沒有明確的治療目標(biāo)，我們無法設(shè)計(jì)特定的治療方法，我們采取了另一種方法，研究了細(xì)胞核內(nèi)的DNA包裝。”貝勒和德克薩斯兒童醫(yī)院的兒科、血液腫瘤學(xué)副教授Marco Gallo博士說。
身體中的每個(gè)細(xì)胞都有大約6.6英尺(2米)的線性DNA，這些DNA儲(chǔ)存在細(xì)胞核中，使細(xì)胞能夠輕松地訪問最常用的基因，同時(shí)將不常用的基因放在一邊。這就像組織一個(gè)衣櫥，把最常用的衣服放在前面，很少穿的放在后面。為了適應(yīng)微小的細(xì)胞核，長DNA分子被折疊、扭曲和環(huán)化，從而形成特定的3D構(gòu)象，有些更緊密，有些更放松，最終可以幫助細(xì)胞表達(dá)完成其工作所需的基因。
關(guān)于兒童腦腫瘤細(xì)胞如何以3D方式組織其基因組，我們所知甚少。“在這項(xiàng)研究中，我們使用high - c技術(shù)來描繪兒科PFA室管膜瘤全基因組的3D結(jié)構(gòu)，并將它們與不同腫瘤類型和非惡性組織的基因組進(jìn)行比較，”該研究的共同資深作者、貝勒和德克薩斯兒童醫(yī)院的兒科、血液學(xué)、腫瘤學(xué)和神經(jīng)外科教授Michael D. Taylor博士說。
“我們發(fā)現(xiàn)PFA室管膜瘤特異性3D基因組特征在可預(yù)測的基因組位置復(fù)發(fā)。有趣的是，這些特征在其他類型的兒童腦癌中并不存在。我們稱它們?yōu)門ULIPs，代表pfa中的B型超長相互作用。”
TULIPs 是DNA非常緊密的特定區(qū)域，因此很難進(jìn)入，這表明細(xì)胞可能不經(jīng)常使用該區(qū)域的基因。“TULIPs 也傾向于在很長的距離上相互作用。染色體兩端的TULIPs 可以找到以驚人的力量相互作用的方法，不同染色體上的TULIPs 也可以收斂并相互作用。我們還發(fā)現(xiàn)，TULIPs 外區(qū)域的DNA看起來更放松。這很重要，因?yàn)門ULIPs 與細(xì)胞的功能有關(guān)。”
TULIPs 攜帶一個(gè)化學(xué)標(biāo)簽，特別是組蛋白H3K9上的一個(gè)甲基，這是一種與DNA相關(guān)的蛋白質(zhì)。Gallo說:“我們發(fā)現(xiàn)抑制PFA患者源培養(yǎng)物中H3K9的標(biāo)記導(dǎo)致TULIPs之間的相互作用減弱，PFA室管膜瘤細(xì)胞存活率總體下降。”“總的來說，我們的數(shù)據(jù)表明，TULIPs在PFA細(xì)胞的三維核空間中的聚集取決于甲基化H3K9組蛋白水平的維持，并且TULIP的相互作用對PFA細(xì)胞活力很重要，為治療開辟了新的潛在場所。”
“TULIPs 介導(dǎo)癌癥行為的機(jī)制尚不完全清楚。我們的目標(biāo)是進(jìn)一步研究TULIPs如何產(chǎn)生并影響PFA室管膜瘤的發(fā)展。TULIPs 在這些高風(fēng)險(xiǎn)腫瘤中的獨(dú)特性促使我們研究針對它們的治療策略，以促進(jìn)腫瘤的消除。”
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2024-7/20240711050133877.htm） | 
