與RNA結(jié)合的蛋白質(zhì)在細(xì)胞的許多過程中都是重要的，并且可以介導(dǎo)一系列的生物功能。DNA和RNA中的一種特殊結(jié)構(gòu)，G-四聯(lián)體（G-quadruplex），是參與DNA和RNA基因表達(dá)的調(diào)控元件。在目前的工作中，研究人員使用理論預(yù)測和分子生物學(xué)實(shí)驗來證明許多染色質(zhì)結(jié)合蛋白與RNA G-四聯(lián)體結(jié)合。有了這些信息，他們可以根據(jù)蛋白質(zhì)結(jié)合RNA g -四聯(lián)體的潛力對蛋白質(zhì)進(jìn)行分類。
該研究結(jié)合了RNA G-四聯(lián)體結(jié)合蛋白的實(shí)驗鑒定和計算方法，建立了一個預(yù)測工具，以確定蛋白質(zhì)與RNA G-四聯(lián)體結(jié)合的概率。研究結(jié)果表明，預(yù)測的蛋白質(zhì)表現(xiàn)出高度的蛋白質(zhì)紊亂和親水性，表明參與轉(zhuǎn)錄和相分離到無膜細(xì)胞器。
研究小組先前已經(jīng)表明，RNA-DNA雙結(jié)合蛋白可能參與DNA損傷反應(yīng)，將DNA和RNA的結(jié)合特性與許多蛋白質(zhì)聯(lián)系起來。在這項新研究中，研究人員擴(kuò)展了RNA結(jié)合蛋白的知識，以鑒定RNA G-四聯(lián)體結(jié)合蛋白。
研究人員還開發(fā)了一種計算工具來評估蛋白質(zhì)的RNA G-四聯(lián)體結(jié)合潛力，這些蛋白質(zhì)可以在http://service.tartaglialab.com/new_submission/clever_G4_classifier上訪問。
有了這些新的結(jié)果，研究人員確定了蛋白質(zhì)-RNA相互作用的特性，并提供了識別G-四聯(lián)體結(jié)合特性的方法，這些特性可能會成為疾病的靶向治療方法。
研究結(jié)果剛剛發(fā)表在《自然通訊》雜志上。
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