來自馬薩諸塞州總醫(yī)院(MGH)、布里格姆婦女醫(yī)院(BWH)、麻省理工學院和哈佛大學布羅德研究所的一組研究人員開發(fā)了一種非侵入性基因檢測方法，可以篩查孕婦的血液，調查胎兒DNA序列變異的所有基因。研究小組通過檢查51名孕婦的血液樣本對該測試進行了評估，發(fā)現(xiàn)該測試能夠捕獲從母親那里遺傳的變異，以及母親身上不存在的與產前診斷相關的新變異。他們的原理驗證分析結果發(fā)表在《新英格蘭醫(yī)學雜志》上。
“我們的研究表明，使用血液測試來篩選胎兒基因組中的大多數(shù)基因是可行的，而不需要像羊膜穿刺術這樣的侵入性程序，”資深作者Michael E. Talkowski博士解釋說，他是MGH基因組醫(yī)學中心主任，哈佛醫(yī)學院(HMS)神經病學副教授，也是Broad研究所的成員。
無創(chuàng)產前檢查(NIPT)，也被稱為產前無細胞dna篩查，允許孕婦接受血液檢查，以篩查胎兒染色體的非常大的變化，如21號染色體的額外拷貝，稱為唐氏綜合癥(21三體);染色體復制:其他染色體的整個副本的獲得或丟失;X和Y性染色體的存在和數(shù)量(表明胎兒的性別)，以及最近與某些胎兒狀況相關的少量變異。
然而，對于許多產前遺傳診斷，有必要確定基因組中蛋白質編碼序列(即外顯子組)的單個核苷酸變化。目前，外顯子組篩查需要通過羊膜穿刺術等侵入性醫(yī)療程序進行基因檢測，這不僅成本高昂，而且對母親和胎兒都有一定的內在風險。這項新開發(fā)的測試可以從母親血液中循環(huán)的DNA中發(fā)現(xiàn)和解釋胎兒外顯子組的變異。該方法被該團隊稱為非侵入性胎兒測序(NIFS)。
這種高分辨率NIFS方法使研究小組能夠調查外顯子組，發(fā)現(xiàn)序列變化，并區(qū)分潛在的致病變異和可能從母親遺傳的良性變異。他們對51名懷孕婦女進行了NIFS方法的測試，這些孕婦都是在馬薩諸塞州總醫(yī)院(Massachusetts General Hospital)和布萊根婦女醫(yī)院(Brigham and Women’s Hospital)接受護理的孕婦群體的代表，布萊根婦女醫(yī)院是麻省總醫(yī)院(Massachusetts General Brigham)醫(yī)療系統(tǒng)的創(chuàng)始成員。
NIFS篩查方法使用母體抽血，而不需要對母親或父親進行單獨的基因檢測。研究小組發(fā)現(xiàn)，無論檢測到多少胎兒DNA，該方法對于發(fā)現(xiàn)胎兒基因組中存在的單堿基DNA變化和小的插入和缺失都非常敏感，而不是在母體基因組中存在。“在我們的回顧性分析中，我們能夠從NIFS方法中準確地發(fā)現(xiàn)和預測胎兒序列變異，從原始數(shù)據(jù)中獲得>99%的靈敏度，使用我們的分析方法過濾后的靈敏度>90%，”MGH神經內科研究員、HMS助理教授哈里森·布蘭德博士說。
在接受現(xiàn)行標準護理基因檢測的14例妊娠中，NIFS方法也進行了評估，NIFS檢測到同一個體中侵入性檢測報告的所有臨床相關變異。
作者對51名孕婦進行了初步測試，但研究結果表明，該測試可能適用于許多樣本。“這項研究的臨床意義可能是深遠的，特別是對于那些從超聲波中懷疑胎兒異常并指示進行侵入性檢查的妊娠，”共同資深作者凱瑟琳·格雷(Kathryn Gray)博士說，她是布里格姆婦女醫(yī)院的產科醫(yī)生和臨床遺傳學家，也是HMS婦產科的助理教授，目前是華盛頓大學的副教授。
“人們早就知道，胎兒序列變異可以從無細胞的胎兒DNA中獲得，外顯子組測序已經是標準護理的一部分，但目前需要侵入性手術。”Talkowski補充說，他也是2015-2020年Desmond和Ann Heathwood MGH研究學者，“這些結果表明，非侵入性測序可能可以從胎兒外顯子組中獲取與標準護理中已經獲得的相同的遺傳信息，但僅通過血液檢查而無需侵入性程序。”
該團隊目前正在與其他研究人員合作，擴大和驗證這些發(fā)現(xiàn)，并進一步開發(fā)這些方法。“我們的基準測試表明，還有更多的優(yōu)化空間。
（文章來源：www.ebiotrade.com/newsf/2023-11） | 
