由科羅拉多大學(xué)醫(yī)學(xué)院教師張帆（Fan Zhang）博士和Anna Helena Jonsson博士領(lǐng)導(dǎo)的新研究可能會(huì)帶來(lái)類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(RA)的新靶向治療，類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎是一種導(dǎo)致關(guān)節(jié)炎癥和破壞的自身免疫性疾病。
他們的研究結(jié)果發(fā)表在《自然》雜志上，反映了作為加速藥物伙伴關(guān)系（Accelerating Medicines Partnership）成員的數(shù)十位研究人員共同努力的成果： 類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎和系統(tǒng)性紅斑狼瘡(AMP: RA/SLE)網(wǎng)絡(luò)的成員。
AMP: RA/SLE網(wǎng)絡(luò)收集了來(lái)自英國(guó)等處的70名紅斑狼瘡患者的炎癥組織。Jonsson領(lǐng)導(dǎo)了一組科學(xué)家對(duì)這些樣本進(jìn)行分析，而Zhang則領(lǐng)導(dǎo)了數(shù)據(jù)的計(jì)算分析。這些努力產(chǎn)生了一個(gè)包含超過(guò)30萬(wàn)個(gè)滑膜組織細(xì)胞的細(xì)胞圖譜。進(jìn)一步的分析顯示，根據(jù)它們的細(xì)胞組成，類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎有六個(gè)不同的亞群。
Jonsson說(shuō)：“我們希望這些數(shù)據(jù)能幫助我們發(fā)現(xiàn)新的治療目標(biāo)，我們想把它公之于眾，這樣全國(guó)和世界各地的研究人員就可以繼續(xù)研究治療類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的新思路。”
不用“guess-and-check ”
Jonsson既是一名執(zhí)業(yè)風(fēng)濕病學(xué)家，也是一名研究人員，他知道風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者對(duì)不同治療的反應(yīng)不同。她說(shuō)，到目前為止，風(fēng)濕病學(xué)家使用“guess-and-check ”的方法來(lái)尋找對(duì)個(gè)體患者有效的治療方法。
利用Zhang和計(jì)算分析團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的新數(shù)據(jù)和強(qiáng)大的計(jì)算分類(lèi)方法，研究人員能夠?qū)A類(lèi)型定量地分類(lèi)為他們所謂的“細(xì)胞型豐度表型”或CTAPs。開(kāi)發(fā)的方法，加上新的細(xì)胞圖譜，可以開(kāi)始確定哪些患者對(duì)哪些治療有反應(yīng)。
“即使你用這些簡(jiǎn)單的標(biāo)記物——T細(xì)胞標(biāo)記物、B細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和其他髓樣細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞——對(duì)類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎炎癥進(jìn)行分類(lèi)，我們發(fā)現(xiàn)，每一種分類(lèi)都與我們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的非常具體的致病細(xì)胞類(lèi)型有關(guān)。之前的類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎研究發(fā)現(xiàn)，被稱(chēng)為外周輔助性T細(xì)胞的T細(xì)胞群與類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎有關(guān)，被稱(chēng)為產(chǎn)生抗體的B細(xì)胞和其他特定細(xì)胞類(lèi)型也是如此。我們發(fā)現(xiàn)它們通常不是一起被發(fā)現(xiàn)的。”
“例如，外周輔助細(xì)胞與B細(xì)胞只存在于一類(lèi)RA中，而致病性巨噬細(xì)胞群體往往存在于另一類(lèi)RA中。正因?yàn)槿绱?，我們可以開(kāi)始詢問(wèn)這些特定合作伙伴如何協(xié)同工作。”
跨學(xué)科研究和跨機(jī)構(gòu)的努力是關(guān)鍵
Zhang說(shuō)：“我認(rèn)為這是跨學(xué)科和大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的研究。許多新的發(fā)現(xiàn)是通過(guò)我們新穎的計(jì)算方法和系統(tǒng)免疫學(xué)方法產(chǎn)生的，我們使用了最先進(jìn)的單細(xì)胞多模態(tài)技術(shù)來(lái)開(kāi)發(fā)這種可重復(fù)的分類(lèi)模式。這是風(fēng)濕病精準(zhǔn)醫(yī)療的一大進(jìn)步。借助強(qiáng)大的人工智能計(jì)算方法，我們能夠整合大型單細(xì)胞組學(xué)、成像和臨床數(shù)據(jù)，以廣義的方式對(duì)患者異質(zhì)性進(jìn)行分層。”
CTAP研究是2018年開(kāi)始的多中心聯(lián)合努力的一部分。它由加速藥物伙伴關(guān)系類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎和系統(tǒng)性紅斑狼瘡網(wǎng)絡(luò)資助，這是由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院和美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院基金會(huì)協(xié)調(diào)的一項(xiàng)倡議。該項(xiàng)目依靠一個(gè)全國(guó)性的研究團(tuán)隊(duì)網(wǎng)絡(luò)，通過(guò)對(duì)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和系統(tǒng)性紅斑狼瘡的關(guān)注，共同努力加深對(duì)自身免疫性疾病的理解。
“對(duì)炎癥亞群的研究也可能用于研究其他自身免疫性疾病或?qū)Π┌Y或感染的免疫反應(yīng)。從那里，它可能會(huì)被用來(lái)增加對(duì)多種不同疾病的了解”。
Zhang補(bǔ)充說(shuō):“建立疾病驅(qū)動(dòng)的計(jì)算人工智能方法將是在多種免疫介導(dǎo)的疾病中產(chǎn)生可測(cè)試的假設(shè)的下一步。”
研究的沃土
對(duì)于Jonsson和Zhang來(lái)說(shuō)，發(fā)表在《自然》雜志上的文章是他們多年工作的成果，而他們的工作始于兩人在哈佛大學(xué)布里格姆婦女醫(yī)院（Brigham and Women's Hospital）（哈佛大學(xué)的教學(xué)醫(yī)院）工作的時(shí)候。當(dāng)他們來(lái)到CU醫(yī)學(xué)院時(shí)，他們帶著這個(gè)項(xiàng)目，希望與CU安舒茨醫(yī)學(xué)院的教職員工建立新的合作關(guān)系。
Jonsson說(shuō):“吸引我們來(lái)這里成立研究小組的原因之一是，科羅拉多大學(xué)醫(yī)學(xué)院的人類(lèi)轉(zhuǎn)化研究非常強(qiáng)大。”
同樣，“我覺(jué)得這將是我們繼續(xù)我們的計(jì)算-實(shí)驗(yàn)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)生產(chǎn)模式的最肥沃的土壤，”Zhang說(shuō)。
（文章來(lái)源：www.ebiotrade.com/newsf/2023-11） | 
